Det er Samferdselsdepartementet som har fastsatt forskrift om saksbehandlingsgebyr for Statens jernbanetilsyn.
Forskriften gjelder gebyrer for å dekke SJTs kostnader ved å behandle søknader etter samtrafikkforskriften når SJT er myndighet etter forskrift om sikkerhet og tekniske forhold ved jernbanen. Forskriften vil ivareta at gebyret for å behandle søknader blir nøytralt og uavhengig av om det er SJT eller Det europeiske jernbanebyrået som behandler søknadene.
Kostnadene med saksbehandlingen omfatter tid til forberedelse, dokumentgjennomgang, besiktelse, rapportering og utsendelse av nødvendige dokumenter m.m.